Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms