Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX20Q9UHI6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms