Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3BQ9UH17 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms