Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms