Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK4Q9UBT3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DKK4Q9UBT3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms