Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms