Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms