Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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