Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms