Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms