Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms