Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL11Q9NVR0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms