Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms