Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5S1Q9NUS5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms