Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms