Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A2Q9NTI2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms