Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms