Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms