Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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