Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms