Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms