Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms