Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf88Q9H8K7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C10orf88Q9H8K7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms