Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms