Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFDQ9GZP0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms