Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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