Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms