Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms