Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT17Q9BSW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT17Q9BSW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms