Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms