Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MESP1Q9BRJ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms