Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF559Q9BR84 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms