Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL4Q9BPW4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL4Q9BPW4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL4Q9BPW4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL4Q9BPW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL4Q9BPW4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL4Q9BPW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms