Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSF1Q96T23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSF1Q96T23 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms