Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAM1Q96QH2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAM1Q96QH2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRAM1Q96QH2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAM1Q96QH2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAM1Q96QH2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAM1Q96QH2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAM1Q96QH2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms