Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms