Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMAQ96QA5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms