Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms