Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms