Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3Q96PU9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms