Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL8

C8orf37, Protein C8orf37, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf37Q96NL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C8orf37Q96NL8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf37Q96NL8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms