Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD1Q96MW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms