Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC43Q96MW1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms