Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms