Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP57Q96MR6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP57Q96MR6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms