Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms