Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms