Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms