Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC41A2Q96JW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC41A2Q96JW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms