Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMNQ96JQ2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms